AI 工具识别疾病驱动启动子突变
快速阅读: 据《科学家》称,法尔博士开发了PromoterAI,利用AI预测启动子变异对基因表达的影响。研究结合GTEx数据,提升模型准确性。
法尔(Farh)博士多年来一直热衷于研究非编码基因组,并开发了人工智能工具来理解剪接和错义突变的影响。受到这些模型表现的启发,他决定创建 PromoterAI。将启动子周围的DNA序列输入模型后,法尔和他的团队首先训练网络来预测一个变异会如何影响DNA的可接近性、组蛋白修饰以及酶与DNA的相互作用,这些因素均参与基因表达的调控。
为了使模型更加稳健,研究人员引入了来自基因型-组织表达数据库第8版(GTEx)的数据。该数据库收录了罕见的非编码启动子变异,这些变异显著地驱动基因表达。该数据库提供了800多名个体的全基因组序列与RNA水平配对数据,从而帮助模型学习预测启动子变异是否会改变基因表达。
(以上内容均由Ai生成)